Vanwege de coronamaatregelen kan de onderwijsvorm of tentaminering afwijken. Zie voor actuele informatie de betreffende cursuspagina’s op Brightspace.

Studiegids

nl en

Integration: Technology trends

Vak
2021-2022

Admission Requirements

Not applicable.

Description

In the post-genomic era, the analysis of large omics datasets has become central to bioinformatics and biological research. The development of many high throughput techniques for genome sequencing and measuring the expression or abundance of genes, proteins and metabolites, has given rise to a plethora of new informatics algorithms and techniques for analysing and interpreting the experimental data. This course will introduce bioinformatics analysis methods for different omics studies and bioimaging data, and will introduce students to commonly used computational methods and frameworks for large-scale analysis.

Course Objectives

  • Understand the impact of the genomic revolution on biology

  • Gain a theoretical and practical understanding of the bioinformatics analysis methods required for interpreting data generated in omics experiments

  • Gain practical experience of commonly used methods and tools

Timetable

The most recent timetable can be found on the student website:

Mode of Instruction

  • Lectures

  • Labs

  • Practical assignments

Assessment Method and Grading

  • 3 Practical assignments: genomics (30%), proteomics (30%) and bioimaging (40%)

The teacher will inform the students how the inspection of and follow-up discussion of the exams will take place.

Literature

Links to reading material and course literature will be provided throughout the course in the lectures and on Brightspace

Registration

Aanmelding voor vakken verloopt via uSis. Hiervoor is de uSis-code van het vak nodig, die te vinden zijn in de Studiegids. Meer info over het inschrijven voor vakken of tentamens is hier te vinden.

MyTimetable

In MyTimetable kun je alle vak- en opleidingsroosters vinden, waarmee jij je persoonlijke rooster kunt samenstellen. Onderwijsactiviteiten waarvoor je in uSis staat ingeschreven, worden automatisch in je rooster getoond. Daarnaast kun je My Timetable gemakkelijk koppelen aan een agenda-app op je telefoon en worden roosterwijzigingen automatisch in je agenda doorgevoerd; bovendien ontvang je desgewenst per e-mail een notificatie van de wijziging.

Vragen? Bekijk de video-instructie, lees de instructie of neem contact op met de ISSC helpdesk.

Brightspace

Inschrijving voor vakken verloopt via uSis. Wanneer je je hier inschrijft voor een bepaald vak krijg je automatisch ook toegang tot de omgeving van dit vak via Brightspace.

Voor meer informatie over Brightspace kun je op deze link klikken om de handleidingen van de universiteit te bekijken. Bij overige vragen of problemen kan contact opgenomen worden met de helpdesk van de universiteit Leiden.

Contact

Onderwijscoördinator Informatica, Riet Derogee