Studiegids

nl en

Computationele Onderzoeksvaardigheden 1 - Deel B

Vak
2024-2025

Toegangseisen

Basiskennis wiskunde op VWO niveau

Beschrijving

LET OP: dit vak vervangt per 2024-2025 het vak Calculus. Op de pagina van Calculus staat de overgangsregeling voor studenten die het vak Calculus nog niet gehaald hebben en Calculus wel in hun vereisten hebben staan.

Computationele onderzoeksvaardigheden zijn onmisbaar in de huidige bio-farmaceutische wetenschap, om steeds complexere data en systemen te beschrijven en begrijpen. Gedurende de bachelor zullen we tijdens de computationele onderzoeksvaardigheden vakken (CO) verschillende aspecten van computationeel onderzoek behandelen: data management, programmeren, statistiek, wiskundig modelleren en cheminformatica, bioinformatica en -omics technieken. De CO leerlijn loopt de hele Bachelor door en kennis en vaardigheden die hier opgedaan worden zijn cruciaal voor het begrijpen en uitvoeren van de onderzoekcyclus.

In CO1B wordt de wiskundige basis gelegd voor het begrijpen en inzetten van wiskundige modellen in geneesmiddelonderzoek, waarmee mogelijke nieuwe geneesmiddelen worden gescreend en klinische studies onderbouwd kunnen worden. Er wordt voortgebouwd op opgedane kennis vanuit Wiskunde B op de middelbare school, met onder andere functies, afgeleiden, en lineaire algebra. Ook wordt er kennis gemaakt met differentiaal vergelijkingen en netwerkmodellen. Daarnaast wordt er gebruik gemaakt van de scripttaal R om functies te visualiseren en het inzetten van wiskunde te ondersteunen, hiermee wordt deels voortgebouwd op de R vaardigheden opgedaan in CO1A.

Leerdoelen

Na afloop van CO1B kan de student:

  • rekenen met functies, differentiëren, en lineaire algebra;

  • differentiaalvergelijkingen lezen en begrijpen in de context van biofarmaceutisch onderzoek;

  • wiskundige problemen met behulp van R visualiseren en oplossen;

  • uitleggen hoe de opgedane wiskundige kennis past in de bio-farmaceutische wetenschape en deze toepassen in praktijksituaties.

Rooster

In MyTimetable (na login) kun je alle vak- en opleidingsroosters vinden, waarmee je het grootste deel van je rooster (zalen en tijden) kunt samenstellen. Onderwijsactiviteiten waarvoor je je via MyStudymap hebt ingeschreven, worden automatisch in je rooster getoond. Daarnaast kun je MyTimetable gemakkelijk koppelen aan een agenda-app op je telefoon en worden roosterwijzigingen automatisch in je agenda doorgevoerd; bovendien ontvang je desgewenst per e-mail een notificatie van de wijziging (stel in onder 'Instellingen' na login).
Vragen over MyTimetable? Bekijk de video, lees de instructie of neem contact op met de ISSC helpdesk

LET OP:
In MyTimetable kunnen we op dit moment niet álle roosterinformatie weergeven, dus CHECK ALTIJD ÓÓK

  • het overzichtsrooster op de Brightspace module ‘Bachelor Bio-Farmaceutische Wetenschappen’ voor een compact overzicht van de opbouw van ieder studiejaar, incl. timing van herkansingen en studiegerelateerde activiteiten zoals voorlichting, symposia, etc.. ÉN

  • het detailrooster op de Brightspace module van ieder vak (na inschrijving), 2-3 weken voor een vak begint. Jouw persoonlijke detailrooster kan nl. afwijken bijv. vanwege opsplitsen in groepen, tussentijdse deadlines, gastdocenten, etc.. Het detailrooster van het vak op Brightspace is leidend.

Onderwijsvorm

Het vak bestaat uit hoorcolleges en werkgroepen. In de hoorcolleges wordt wiskundige theorie behandeld. In de werkcolleges worden wiskundige problemen met de hand opgelost en wordt de wiskunde in R toegepast.

Toetsing en weging

Schriftelijk tentamen.

LET OP: dit vak vervangt per 2024-2025 het vak Calculus. Op de pagina van Calculus staat de overgangsregeling voor studenten die het vak Calculus nog niet gehaald hebben en Calculus wel in hun vereisten hebben staan.

Literatuurlijst

  • A.Garfinkel, J.Shertsov, Y.Guo, Modeling Life, the mathematics of biological systems. ISBN 978-3-319-59730 of 978-3-319-59731-7 (e-book, gratis via Springerlink op universitair netwerk)

  • De gebruikte software, R en Rstudio in een server omgeving (Noteable), die via Brightspace te bereiken is.

Inschrijven

Om deel te kunnen nemen aan dit vak is inschrijving in uSis verplicht, gebruik daarvoor My StudyMap. Voor dit vak geldt de standaard inschrijftermijn van 5 kalenderdagen vóór de eerste activiteit van het vak.

  • Inschrijven voor het (her)tentamen kan tot uiterlijk 10 kalenderdagen vóór de (her)tentamendatum; daarna kun je alleen deelnemen als er sprake is van zwaarwegende persoonlijke omstandigheden.

  • NB Schrijf je alleen in voor de onderdelen die je daadwerkelijk gaat volgen, ook uitschrijven als je niet deelneemt is verplicht.

Contact

Dhr. Dr. R. J. Kooman en Dhr. Dr. H. van Mil

Opmerkingen

Software
Vanaf collegejaar 2024/2025 werkt de faculteit Wiskunde en Natuurwetenschappen met het software distributieplatform Academic Software. Via het platform kun je toegang krijgen tot de software die je nodig hebt voor bepaalde vakken in je studie. Voor sommige software moet je laptop aan bepaalde systeemeisen voldoen. Dit staat aangegeven bij de software. Belangrijk is dat je de software installeert voor de start van het vak. Meer informatie over het laptopprofiel vind je op de studentenwebsite.