Toegangseisen
Niet van toepassing.
Beschrijving
Allereerst wordt in deze cursus ingegaan op de fysische principes van licht, om zo een basis te leggen voor beter begrip van de microscoop. Vervolgens wordt in colleges en practica de lichtmicroscoop ontleed, om een goed begrip ervan te krijgen en deze goed te leren gebruiken. Verschillende contrasttechnieken als DIC en fase-contrast zullen aan bod komen. Tevens zal uitgebreid worden ingegaan op preparaatbereiding en histologische kleuringen en wordt de historie van de microscopie behandeld. Daarna zullen de fluorescentiemicroscoop en de confocale microscoop worden behandeld en gebruikt. Geavanceerde technieken uit de fluorescentiemicroscopie (bijv. FRAP, FRET, FCS, FLIM, PALM) zullen na bestudering van uitgedeelde literatuur door de studenten aan elkaar worden gepresenteerd. Middels gastcolleges en demonstraties zullen technieken als elektronenmicroscopie, atomic force microscopy (AFM), single-molecule microscopie en micro CT behandeld worden.
Leerdoelen
Na afloop van het vak kan de student:
Het spectrum van elektromagnetische straling beschrijven, voorbeelden en toepassingen geven van verschillende soorten straling, en uitleggen hoe licht ontstaat en hoe deze straling interacteert met materie.
Uitleggen hoe de lichtmicroscoop is opgebouwd, de afzonderlijke onderdelen herkennen, hun functie benoemen en uitleggen wat er op de onderdelen aangegeven wordt.
Uitleggen hoe fysische principes de beeldvorming in een microscoop bepalen, en hoe de verschillende stralengangen zich door de microscoop bewegen.
De werking van optische contrastverhogende technieken uitleggen, benoemen welke extra onderdelen hiervoor nodig zijn, en waar zich deze in de microscoop bevinden.
Benoemen welke stappen bij preparaatbereiding kunnen worden gezet, uitleggen waarom deze worden gezet, en uitleggen welke effecten deze hebben op preparaat, voorbereidingstijd, en beeldvorming.
De belangrijkste ontwikkelingen in de geschiedenis van de microscopie benoemen.
Beschrijven hoe en waarom fluorescentie wordt gebruikt in biologisch onderzoek, en uitleggen hoe een fluorescentiemicroscoop en een confocale microscoop werken.
Begrijpen hoe een beeld, dat is verkregen met een microscoop, wordt omgezet naar een digitaal beeld, en uitleggen hoe eenvoudige bewerkingen en kwantitatieve analyses op deze beelden kunnen worden uitgevoerd.
Een overzicht maken van het principe, voor- en nadelen, en mogelijke toepassingen van een geavanceerde fluorescentiemicroscopie-techniek, dit overzicht mondeling presenteren, en alle gepresenteerde technieken met elkaar vergelijken.
De basis van elektronenmicroscopie, single-molecule microscopie, AFM en MicroCT uitleggen en weergeven welke voor- en nadelen deze technieken hebben ten opzichte van elkaar en van lichtmicroscopie, en illustreren hoe deze technieken kunnen worden toegepast in wetenschappelijk onderzoek.
Rooster
Voor detailrooster, zie Brightspace.
Week 1: Basale fysica van licht. Lichtmicroscopie. Histologie. Contrasttechnieken.
Week 2: Fluorescentiemicroscopie. Historie van de microscopie. Deeltentamen 1. Confocale microscopie.
Week 3: Confocale microscopie. Beeldverwerking. Presentatie literatuuropdracht.
Week 4: Gastcolleges geavanceerde technieken. Deeltentamen 2.
In MyTimetable kun je alle vak- en opleidingsroosters vinden, waarmee jij je persoonlijke rooster kunt samenstellen. Onderwijsactiviteiten waarvoor je je via MyStudyMap hebt ingeschreven, worden automatisch in je rooster getoond.
Daarnaast kun je My Timetable gemakkelijk koppelen aan een agenda-app op je telefoon en worden roosterwijzigingen automatisch in je agenda doorgevoerd; bovendien ontvang je desgewenst per e-mail een notificatie van de wijziging. Je kunt notificaties aanzetten bij Instellingen, nadat je bent ingelogd.
Vragen? Bekijk de video, lees de instructie of neem contact op met de ISSC helpdesk.
Let op: Joint Degree studenten Leiden/Delft dienen de informatie uit de Leidse en Delftse MyTimetables samen te voegen om een volledig rooster te zien. Deze video legt uit hoe dat werkt.
Onderwijsvorm
Hoorcolleges, practica, werkcolleges/nabesprekingen en zelfstudie.
Toetsing en weging
Twee deeltentamens, presentatie, kohlerexamen.
Het eind cijfer bestaat uit de volgende deelcijfers:
Tentamen 1 (40%)
Kohlerexamen (pass/fail)
Tentamen 2 (40%)
Presentatie (20%)
Bodemcijfer:
Voor vakken uit jaar 2 en 3 van de bachelor geldt een bodemcijfer van een onafgeronde 5,5.
Als een vak 2 of meer schriftelijke deeltentamens heeft, geldt het bodemcijfer alleen voor het gewogen gemiddelde van de tentamens.
Bij deelcijfers uit andere onderdelen dan tentamens (bijv. practica, werkcolleges, schrijfopdrachten) geldt wel voor de losse onderdelen het bodemcijfer.
Raadpleeg het Studentenstatuut voor een overzicht van alle richtlijnen (zie daarin Regels en Richtlijnen Examencommissie voor geldigheid van deelcijfers).
Literatuurlijst
Eventuele aanvullende literatuur wordt tijdens cursus uitgereikt.
Inschrijven
Als student ben je zelf verantwoordelijk voor het tijdig inschrijven via MyStudyMap.
In deze korte video zie je stap voor stap hoe je je kunt inschrijven voor cursussen in MyStudyMap.
Uitgebreide informatie over de werking van MyStudyMap vind je hier.
Er zijn twee inschrijfperiodes per jaar:
de inschrijving voor het najaar opent in juli
de inschrijving voor het voorjaar opent in december
Zie deze pagina voor meer informatie over deadlines en inschrijven voor vakken en tentamens.
Let op:
Het is verplicht om je in te schrijven voor alle activiteiten die je gaat volgen van een vak.
Je inschrijving is pas voltooid wanneer je je cursusplanning indient in het tabblad ‘Klaar voor inschrijving’ door op ‘indienen’ te klikken.
Niet ingeschreven zijn voor een (her)tentamen betekent dat je niet mag deelnemen aan het (her)tentamen.
Contact
Coördinator: Dr. Ir. J.J. Willemse
E-mail: Jwillemse@biology.leidenuniv.nl
Opmerkingen
Inzage en feedback op het tentamen: datum nog niet bekend.
Powerpointpresentaties van alle colleges, vragen en opdrachten en de informatie nodig voor de literatuuropdracht zullen op Brightspace worden gezet.
Maximaal aantal deelnemers: 96
Software
Vanaf collegejaar 2024/2025 werkt de faculteit Wiskunde en Natuurwetenschappen met het software distributieplatform Academic Software. Via het platform kun je toegang krijgen tot de software die je nodig hebt voor bepaalde vakken in je studie. Voor sommige software moet je laptop aan bepaalde systeemeisen voldoen. Dit staat aangegeven bij de software. Belangrijk is dat je de software installeert voor de start van het vak. Meer informatie over het laptopprofiel vind je op de studentenwebsite.