Studiegids

nl en

Biochemie (voor bioinformatica)

Vak
2024-2025

Toegangseisen

n.v.t.

Beschrijving

Basale biochemische principes en belangrijke biochemische technieken komen aan de orde. Verschillende technieken van eiwitzuivering worden toegepast. De eigenschappen en de kinetiek van enzymen betrokken bij de glycolyse dan wel bij afbraak van polysachariden wordt o.a. met spectroscopische technieken bestudeerd. De resultaten van de experimenten worden schriftelijk (verslag in de vorm van een wetenschappelijk artikel) en mondeling (presentatie) gepresenteerd.

Leerdoelen

Aan het einde van de cursus kunnen studenten:  
1. Basale biochemische technieken (chromatografie, dialyse,  gelektroforese, enzym-assay, kinetiekmeting, spectrofotometrie) uitvoeren met behulp van een gegeven protocol. 
2. Uitleggen onder welke omstandigheden de scheidingstechnieken van eiwitten kunnen worden uitgevoerd en wat de mogelijkheden en beperkingen van de technieken zijn.  
3. Chemisch rekenen en bufferoplossingen maken en uitleggen hoe deze oplossingen werken.  
4. De basale werking van een enzym uitleggen.  
5. Uitleggen hoe verschillende eigenschappen van eiwitten (i.e. lading, polariteit, hydrofobiciteit) hun gedrag in basale biochemische technieken bepalen.  
6. De IUPAC-naam kunnen geven van een structuur van een klein organisch molecuul, en stereo-isomeren van organische moleculen kunnen herkennen.  
7. Benoemen in welke hoofdklassen enzymen zijn ingedeeld en globaal welk type reactie elke klasse katalyseert.  
8. Een verslag schrijven in de vorm van een wetenschappelijk artikel.     

Rooster

In MyTimetable kun je alle vak- en opleidingsroosters vinden, waarmee jij je persoonlijke rooster kunt samenstellen. Onderwijsactiviteiten waarvoor je je via MyStudyMap hebt ingeschreven, worden automatisch in je rooster getoond.

Daarnaast kun je My Timetable gemakkelijk koppelen aan een agenda-app op je telefoon en worden roosterwijzigingen automatisch in je agenda doorgevoerd; bovendien ontvang je desgewenst per e-mail een notificatie van de wijziging. Je kunt notificaties aanzetten bij Instellingen, nadat je bent ingelogd.

Vragen? Bekijk de video, lees de instructie of neem contact op met de ISSC helpdesk.

Let op: Joint Degree studenten Leiden/Delft dienen de informatie uit de Leidse en Delftse MyTimetables samen te voegen om een volledig rooster te zien. Deze video legt uit hoe dat werkt.

Onderwijsvorm

Practicum, hoorcolleges, werkcolleges, zelfstudie.

Toetsing en weging

Het eindcijfer bestaat uit de volgende deelcijfers:

  • Tentamen (50%)

  • Verslag LDH (40%)

  • Labjournaal (5%)

  • Algemene indruk praktisch werk (5%)

Bodemcijfer:
Voor vakken uit jaar 2 en 3 van de bachelor geldt een bodemcijfer van een onafgeronde 5,5.

Als een vak 2 of meer schriftelijke deeltentamens heeft, geldt het bodemcijfer alleen voor het gewogen gemiddelde van de tentamens.
Bij deelcijfers uit andere onderdelen dan tentamens (bijv. practica, werkcolleges, schrijfopdrachten) geldt wel voor de losse onderdelen het bodemcijfer.

Raadpleeg het Studentenstatuut voor een overzicht van alle richtlijnen (zie daarin Regels en Richtlijnen Examencommissie voor geldigheid van deelcijfers).

Literatuurlijst

Syllabus, wetenschappelijke artikelen.
Aanvullende informatie en cursusdocumenten staan op Brightspace en in LabBuddy.

Inschrijven

Als student ben je zelf verantwoordelijk voor het tijdig inschrijven via MyStudyMap.

In deze korte video zie je stap voor stap hoe je je kunt inschrijven voor cursussen in MyStudyMap.
Uitgebreide informatie over de werking van MyStudyMap vind je hier.

Er zijn twee inschrijfperiodes per jaar:

  • de inschrijving voor het najaar opent in juli

  • de inschrijving voor het voorjaar opent in december

Zie deze pagina voor meer informatie over deadlines en inschrijven voor vakken en tentamens.

Let op:

  • Het is verplicht om je in te schrijven voor alle activiteiten die je gaat volgen van een vak.

  • Je inschrijving is pas voltooid wanneer je je cursusplanning indient in het tabblad ‘Klaar voor inschrijving’ door op ‘indienen’ te klikken.

  • Niet ingeschreven zijn voor een (her)tentamen betekent dat je niet mag deelnemen aan het (her)tentamen.

Contact

Coordinatoren: Dr. S. Irmisch
Email: s.irmisch@biology.leidenuniv.nl

Opmerkingen

Inzage en feedback op het tentamen: datum nog niet bekend.

Software
Vanaf collegejaar 2024/2025 werkt de faculteit Wiskunde en Natuurwetenschappen met het software distributieplatform Academic Software. Via het platform kun je toegang krijgen tot de software die je nodig hebt voor bepaalde vakken in je studie. Voor sommige software moet je laptop aan bepaalde systeemeisen voldoen. Dit staat aangegeven bij de software. Belangrijk is dat je de software installeert voor de start van het vak. Meer informatie over het laptopprofiel vind je op de studentenwebsite.