Coordinator
Dr. Remko Offringa
Email: r.offringa@biology.leidenuniv.nl
Omschrijving
Met het in kaart brengen en sequencen van complete genomen en het bepalen van de functies van de individuele genen heeft de moleculaire genetica de afgelopen decennia aan de basis gestaan van belangrijke doorbraken in de medische wetenschap, de gewasverbetering, en de biotechnologie. Deze cursus geeft een theoretisch overzicht van het vakgebied en de veel gebruikte benaderingen, en biedt praktische training in een aantal moleculair genetische methoden. In een 10-tal colleges zullen de historie en de principes van de genetica worden besproken, met de nadruk op de genetica van eukaryoten. Tijdens de practica zullen de cursisten in tweetallen een aantal experimenten uitvoeren, waarbij er met de genetische modelorganismen Agrobacterium tumefaciens, bakkersgist en de zandraket (Arabidopsis thaliana) wordt gewerkt. Het leren zelfstandig uitvoeren van experimenten en het interpreteren van de resultaten staat hierbij centraal. Met de experimenten en de daarbij behorende voorcolleges worden o.a. de volgende begrippen nader toegelicht: forward en reverse genetica, mutagenese en mutant selectie, allelen, koppeling, complementatie, moleculaire markers, functional genomics, DNA transformatie, bestuderen van genexpressie m.b.v. reporter genen, in silico analyse van genen.
Onderwijsvormen
Hoorcolleges, practicum, literatuurstudie, database analyse, presenteren, opzetten van een eigen onderzoekje, verslag schrijven.
Studiemateriaal
Practicumhandleiding
Verplicht boek: Alberts et al., Molecular Biology of the Cell, Garland Science NY, 5e ed. 2008
Toetsing
Tentamen, presentatie, deelname discussie, verslag
Ingangseis/advies
2e jaars cursussen Biochemie (Linthorst) en Moleculaire Biologie (Van Heusden)
Rooster
Het dagelijks programma is van 9.00 tot ca. 17.00, maar meestal zul je voor 16.00 klaar zijn. Het schema in de eerste twee weken bestaat uit ’s ochtends colleges, waarna rond 11.00 begonnen wordt met het praktische werk, of met een literatuurstudie. In de derde en vierde week is er tijd ingeroosterd voor het schrijven van een verslag en het voorbereiden van een eindpresentatie over één van de experimenten. Dinsdag 23-2 zijn de eindpresentaties van de verschillende experimenten gepland. De cursus eindigt op vrijdag 26-2 met een afsluitend tentamen van 10.00 tot 12.00, en woensdag 24-2 en donderdag 25-2 worden vrij gehouden voor het voorbereiden van het tentamen.
Inschrijving
Via Utwist en daarna aanmelden via black board
Gebruik Digitale Leeromgeving
Ja, er wordt gebruik gemaakt van black board, voor algemene aankondigingen, en het rooster, de handleiding, alle colleges en de resultaten en verslagen van de experimenten zullen via black board beschikbaar worden gesteld.
Doelstelling
Verdieping van de kennis over de genetica en de daarbij gebruikte moleculaire methoden, het opdoen van hands-on ervaring met moleculair genetische technieken, en training in algemene onderzoeksvaardigheden, zoals het bedenken en plannen van experimenten, en het beschrijven en presenteren van de onderzoeksresultaten.
Opmerkingen
Dagelijkse aanwezigheid is vereist. Bij onvoorziene afwezigheid door bijv. ziekte moet de cursist zelf zorgen dat de gemiste stof wordt ingehaald. Bij langere afwezigheid (meer dan 3 dagen) wordt in principe geen eindcijfer meer uitgereikt, en moet de cursus worden overgedaan.