Coordinator
Marco Roos
Email: roos@nhn.leidenuniv.nl
2 WEKEN – 3 EC
4 WEKEN – 6 EC
Omschrijving
- De studenten krijgen, door colleges, oefeningen, opdrachten en, zeer belangrijk, eigen onderzoek, inzicht in de grondslagen en methodologie van systematiek en in het bijzonder van fylogenie reconstructie. Zij leren datamatrices opstellen, door het formuleren van soorts- en homologiehypotheses, en het uitvoeren van kenmerkanalyses en coderen van kenmerktoestanden. Vervolgens worden de datamatrices geanalyseerd met computerprogrammatuur, waarvan de werking en de methodes transparant gemaakt worden. Hierbij wordt ook ruime aandacht besteed aan de verwerking van moleculaire gegevens, aansluitend op het onderdeel moleculaire technieken. Door de resultaten te verwerken krijgen de studenten kijk op de grondslagen van de taxonomie, met name de principes van classificatie en nomenclatuur, en het maken van identificatiemiddelen. Eveneens wordt kennis gemaakt met biodiversiteitsanalyses op taxonomisch niveau en biogeografie (verspreidingen van soorten). Tevens wordt een overzicht gepresenteerd van onderzoek in NHN en Naturalis, van systematische disciplines en van toepassingen van systematische informatie.
Onderwijsvormen
Practicum, hoorcolleges, demonstraties, oefeningen/opdrachten, eigen onderzoek.
Studiemateriaal
Syllabus.
Toetsing
Schriftelijk tentamen, schriftelijke rapportage, mondelinge presentatie.
Ingangseis/advies
Propedeuse.
Rooster
Globaal:
Week 1: Botanisch (morfologie hogere planten, bestuivingssyndromen, vrucht dispersie, determineren, paleobotanie)
Week 2: Zoologisch (weekdieren, insekten, paleozoologie)
Week 3: Soortconcepten, start Fylogenie
Week 4: Fylogenie, Biogeografie
Week 5: Eigen onderzoek (helft onderwerpen botanisch, helft zoologisch)
Week 6: Eigen onderzoek, verslaggeving, presentatie.
Inschrijving
Via Utwist of via Peter van Welzen (welzen@nhn.leidenuniv.nl).
Gebruik Digitale Leeromgeving
Blackboard, computeralgorithmes.
Doelstelling
Inzicht in de theorie en praktijk van vergelijkend biologisch onderzoek, de systematische aanpak van biodiversiteitstudies en fylogenetische vraagstellingen.
Vergroting van het inzicht in een aantal basale biologische concepten (soort, homologie, ruimtelijke schaalgroottes, tijdschalen) en methoden (grondslagen systematiek & vergelijkende biologie, macro-evolutie, fylogeniereconstructie, interpretatie fylogenetische informatie, evo-devo)
Opmerkingen
Geen.