Prospectus

nl en

Molecular Genetics of Plants and Microbes (for Bioinformatics)

Course
2024-2025

Toegangseisen

Actieve kennis van Moleculaire Genetica 1 is vereist om aan te kunnen sluiten bij Moleculaire genetica van planten en microben.

Beschrijving

Belangrijke doorbraken in de medische wetenschap, gewasverbetering en biotechnologie zijn vaak tot stand gekomen door begrip van moleculaire genetica en daarop gebaseerde praktische toepassingen. In een korte cursus kunnen natuurlijk niet alle onderwerpen aan bod komen; voortbouwend op Moleculaire Genetica 1 wordt bij Moleculaire genetica van planten en microben vooral nader kennis gemaakt met de mogelijkheden die moleculaire genetica biedt voor het onderzoek aan planten en daarmee ook voor de groene biotechnologie.
Onderwerpen die aan bod komen zijn o.a. het gebruik van mutanten, complementatie, genetische koppeling, meiotische recombinatie, moleculaire markers, transformatie, DNA overdracht via Agrobacterium, genregulatie, epigenetica, plaatsgerichte mutagenese (o.a. via CRISPR/Cas technologie) en gene targeting. Tijdens colleges zullen ook originele onderzoeksartikelen worden geïntroduceerd die door studenten nader worden bestudeerd. Bij de cursus is zelfstudie een zeer belangrijk onderdeel.

Leerdoelen

Na afloop van de cursus kunnen studenten:

  • Essentiële moleculaire en genetische factoren beschrijven die van invloed zijn op plant tolerantie van abiotische stress, met name droogte.

  • Het analyseren van de significantie van het microbioom in het verbeteren van plant tolerantie tegen droogte.

  • Het evalueren van de rol van transcriptiefactoren in plant tolerantie tegen droogte.

  • Het toepassen van verschillende hulpmiddelen en technologieën voor het evalueren van genexpressie regulatie, en reconstructie van genregulatie netwerken waar transcriptiefactoren bij betrokken zijn.

  • Het toepassen van -omics technologieën in microbieel onderzoek.

  • Het interpreteren van genoom reconstructies en alignment methodes.

  • De principes van comparative genomics begrijpen.

  • Wetenschappelijke artikelen over moleculaire genetica effectief samenvatten en presenteren.

Rooster

In MyTimetable kun je alle vak- en opleidingsroosters vinden, waarmee jij je persoonlijke rooster kunt samenstellen. Onderwijsactiviteiten waarvoor je je via MyStudyMap hebt ingeschreven, worden automatisch in je rooster getoond.

Daarnaast kun je My Timetable gemakkelijk koppelen aan een agenda-app op je telefoon en worden roosterwijzigingen automatisch in je agenda doorgevoerd; bovendien ontvang je desgewenst per e-mail een notificatie van de wijziging. Je kunt notificaties aanzetten bij Instellingen, nadat je bent ingelogd.

Vragen? Bekijk de video, lees de instructie of neem contact op met de ISSC helpdesk.

Let op: Joint Degree studenten Leiden/Delft dienen de informatie uit de Leidse en Delftse MyTimetables samen te voegen om een volledig rooster te zien. Deze video legt uit hoe dat werkt.

Onderwijsvorm

Hoorcolleges en literatuurstudies. Beide onderdelen zijn verplicht.

Toetsing en weging

Het eindcijfer is opgebouwd uit de volgende onderdelen:

  • Tentamen (70%)

  • Literatuurstudie (30%)

Bodemcijfer:
Voor vakken uit jaar 2 en 3 van de bachelor geldt een bodemcijfer van een onafgeronde 5,5.

Als een vak 2 of meer schriftelijke deeltentamens heeft, geldt het bodemcijfer alleen voor het gewogen gemiddelde van de tentamens.
Bij deelcijfers uit andere onderdelen dan tentamens (bijv. practica, werkcolleges, schrijfopdrachten) geldt wel voor de losse onderdelen het bodemcijfer.

Raadpleeg het Studentenstatuut voor een overzicht van alle richtlijnen (zie daarin Regels en Richtlijnen Examencommissie voor geldigheid van deelcijfers).

Literatuurlijst

  • Wetenschappelijke artikelen (via Brightspace)

  • Alberts et al., Molecular Biology of the Cell, Garland Science NY, 6e ed.

Inschrijven

Als student ben je zelf verantwoordelijk voor het tijdig inschrijven via MyStudyMap.

In deze korte video zie je stap voor stap hoe je je kunt inschrijven voor cursussen in MyStudyMap.
Uitgebreide informatie over de werking van MyStudyMap vind je hier.

Er zijn twee inschrijfperiodes per jaar:

  • de inschrijving voor het najaar opent in juli

  • de inschrijving voor het voorjaar opent in december

Zie deze pagina voor meer informatie over deadlines en inschrijven voor vakken en tentamens.

Let op:

  • Het is verplicht om je in te schrijven voor alle activiteiten die je gaat volgen van een vak.

  • Je inschrijving is pas voltooid wanneer je je cursusplanning indient in het tabblad ‘Klaar voor inschrijving’ door op ‘indienen’ te klikken.

  • Niet ingeschreven zijn voor een (her)tentamen betekent dat je niet mag deelnemen aan het (her)tentamen.

Contact

Coördinator: Dr. S. Balazadeh and Dr. V.J. Carrion Bravo
E-mail: s.balazadeh@biology.leidenuniv.nl and v.j.carrion.bravo@biology.leidenuniv.nl

Opmerkingen

Aanwezigheid is verplicht.
De slides van de hoorcolleges, de literatuur en instructies zullen beschikbaar zijn via Brightspace.

Software
Vanaf collegejaar 2024/2025 werkt de faculteit Wiskunde en Natuurwetenschappen met het software distributieplatform Academic Software. Via het platform kun je toegang krijgen tot de software die je nodig hebt voor bepaalde vakken in je studie. Voor sommige software moet je laptop aan bepaalde systeemeisen voldoen. Dit staat aangegeven bij de software. Belangrijk is dat je de software installeert voor de start van het vak. Meer informatie over het laptopprofiel vind je op de studentenwebsite.