Toegangseisen
Biodiversiteit – Taxa in Ruimte en Tijd deel 1
Contact
Coordinator: Prof.dr. P.C. van Welzen
Email: welzen@nhn.leidenuniv.nl
Beschrijving
De studenten krijgen, als vervolg op de colleges, oefeningen en opdrachten in deel 1 verder inzicht in de grondslagen en methodologie van systematiek en in het bijzonder van fylogenie reconstructie door toepassing in een eigen onderzoek: vraagstelling uitwerken, het bestuderen van materiaal, het formuleren van soorts- en homologiehypotheses, datamatrices opstellen, het coderen van kenmerken in matrices, het fylogenetisch analyseren van de datamatrices met computerprogrammatuur, het verkrijgen en verwerken van moleculaire gegevens, rapporteren van gegevens (verslag) en presenteren. Door de resultaten te verwerken krijgen de studenten kijk op de grondslagen van de taxonomie, met name de principes van classificatie en nomenclatuur, en het maken van identificatiemiddelen. Eveneens worden biogeografische analyses uitgevoerd. Daarnaast wordt onderzoek in NCB Naturalis gepresenteerd, en wat toepassingen van systematische informatie.
Leerdoelen
Doelstellingen:
Toepassing van de theorie en praktijk van vergelijkend biologisch onderzoek, de systematische aanpak van biodiversiteitstudies en fylogenetische vraagstellingen.
Vergroting van het inzicht in een aantal basale biologische concepten (soort, homologie, ruimtelijke schaalgroottes, tijdschalen) en methoden (grondslagen systematiek & vergelijkende biologie, macro-evolutie, fylogeniereconstructie, interpretatie fylogenetische informatie). Daarnaast oefening in verslaglegging en presentatie van gegevens.
Eindtermen:
Het toepassen van in deel 1 verworven theoretische vaardigheden m.b.t. het opstellen van een datamatrix, het uitvoeren van een fylogenetische en een moleculaire analyse, het gebruik van Genebank en het toevoegen van moleculaire gegevens, het interpreteren van resultaten in de context van eerdere kennis.
Rooster
Van 29 oktober 2012 tot en met 9 november 2012, voor detailrooster zie Blackboard.
Globaal: Eigen onderzoek (helft onderwerpen botanisch, helft zoologisch), verslaggeving, presentatie.
Onderwijsvorm
Practicum, eigen onderzoek.
Toetsing
Schriftelijke rapportage, mondelinge presentatie
Blackboard
Aanvullende informatie en cursus documenten staan op Blackboard, evenals de computeralgorithmes.
Literatuur
Syllabus Biodiversiteit 1
Aanmelden
Via USIS en daarna enrollen in Blackboard