Toegangseisen
n.v.t.
Contact
Coördinator: Dr. M. v.d. Zee
Email: m.van.der.zee@biology.leidenuniv.nl
Beschrijving
-Dit vak geeft een totaaloverzicht van de evolutiebiologie. Begrippen uit het eerste jaar, zoals adaptatie, soortvorming, seksueel dimorfisme en altruïsme worden kort herhaald. In dee eerste week wordt gefocust op fylogeniereconstructie. Met DNA dat je uit varens geïsoleerd hebt, ga je zelf een moleculaire stamboom maken. In dee tweede week ligt de nadruk op populatiegenetica, zowel met computermodellen als met een selectie-practicum met Drosophila, waarbij je zelf selectie uitvoert, genotypeert m.b.v. een SNP analyse en rekent met allelfrequenties. Verder wordt de kennis van de geschiedenis van het leven stevig uitgebreid, onder andere met een fossielenpracticum. In de laatste week wordt aandacht besteed aan evo-devo (evolutionary developmental biology): de ontwikkelingsbiologische basis van evolutionaire veranderingen. Accenten worden tevens gelegd op veroudering, life histories ende relevantie van evolutie voor de menselijke gezondheid. Evolutionaire aspecten van vogelgriep, HIV en kanker komen aan de orde.
Leerdoelen
Doelstellingen:
Totaaloverzicht van evolutiebiologie
Eindtermen:
De essentie van verschillende fylogeniereconstructiemethoden (parsimonie, maximum likelihood, Bayesiaanse analys) begrijpen.
het kunnen analyseren, interpreteren en beoordelen van stambomen en hun ondersteuning.
Moleculaire technieken, zoals DNA isolatie, PCR, sequensen en SNP analyse begrijpen en in staat zijn de juiste techniek te kiezen.
Kunnen rekenen met allelfrequenties, Hardy-Weinberg, linkage disequilibrium en begrijpen wat er gebeurt met allelfrequenties onder selectie
De moleculaire basis begrijpen van variatie en evolutionaire veranderingen.
Het leveren van hypothesen over de oorsprong van het leven en feitenkennis over de geschiedenis van het leven.
Het evolutionair verklaren van fenomenen als seksueel dimorfisme, sociaal gedrag en veroudering.
Rooster
Van 23 september 2019 tot en met 25 oktober 2019, voor detailrooster zie Blackboard.
Onderwijsvorm
Colleges, practicum, werkcolleges, en veel computerpractica
Toetsing
Tentamen, practicumverslagen en labjournaal.
Blackboard
Aanvullende informatie en cursusdocumenten staan op Blackboard
Literatuur
Het volgende boek is verplicht:
Evolutionary Analysis van Scott Freeman en Jon C. Herron, Publisher: Benjamin Cummings, 5th edition ISBN 13: 1-292-06127-8
De cursus volgt de structuur van dit boek. Sommige computerpractica verwijzen naar het boek. Er wordt zelfstudietijd ingeroosterd voor dit boek.
Aanmelden
Via USIS en daarna enrollen in Blackboard